Yaptığı açıklamada Chomsky iç savaşın Müslüman Kardeşlerin reaksiyonuna bağlı olduğunu belirtti. Chomsky, Müslüman Kardeşlerin şu ana kadar oldukça ölçülü davrandığını ancak birçok Ortadoğu uzmanının Mısır Ordusu’nun uyguladığı şiddetin Müslüman Kardeşleri şiddete kışkırtma ve daha büyük katliamları meşrulaştırma amacı taşıdığını belirttiğini anımsattı.
Ünlü bilim adamı, "Bence Mısır Ordusu zaten bir darbe yapmak istiyordu ve 30 Hazirandaki büyük gösteriler onlara bunu bir gerekçe olarak kullanma fırsatı verdi." şeklinde konuştu.
ABD ve AB’nin Mısır’daki darbeyle ilgili tutumuyla ilgili olarak "Mısır ordusu ile ilişkileri kesmek istemiyorlar. Ama katliamlara da göz yummak istemiyorlar. Bu da ister istemez çekimser bir tutumda olmalarına neden oluyor." diyen Chomsky, darbenin dış bağlantılarıyla ilgili şunları söyledi:
“Dış politika bağlamında gördüğüm bağlantılar, Arap Dünyasıyla bağlantılı olanlar. Katar’ın Müslüman Kardeşleri, Suudi Arabistan ve BAE’nin askeri yönetimi desteklediğini görüyorum.”